Регулярно проводите проверку и дефрагментацию диска. После дефрагментации головке винчестера приходится меньше перемещаться, таким образом требуется меньше времени для поиска и доступа к информации, меньше изнашивается сам НЖМД. Также желательно хотя бы раз в год проводить полное форматирование диска, что также ускоряет работу.
Рекомендуется держать жесткие диски и накопители CDROM на разных шлейфах, так как эти устройства работают на различных скоростях. Помните, что покупать шлейф нужно 80-жильный, так как он поддерживает современные режимы работы. На старом же, 40-жильном, шлейфе жесткий диск UDMA100 будет работать как DMA33, хотя в BIOS и ОС будет писаться, что все настроено правильно.

Для SATA и SATA2 - винчестеров проблема с выбором шлейфов отпадает, но все остальные
При работе на компьютере пытайтесь не скапливать на дисках тысячи файлов. Большое количество файлов сильно тормозит работу диска, особенно при использовании файловой системы FAT32.
При наличии диска объемом более 40 Гб с файловой системой FAT32 его необходимо разбивать на несколько логических дисков, так как это сократит потерю свободного места в больших кластерах.
При использовании NTFS можно отключить функцию обновления сведений о последнем доступе к файлу. при большом количестве файлов в папке этот процесс может сильно замедлить работу. Отключить его можно в реестре по адресу KEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\FileSystem заменив в параметре dword NtfsDisableLastAccessUpdate 0 на 1 - 00000001.
Установите в настройках системы работу накопителей в режиме DMA.
Рекомендуется при наличии ОЗУ более 128 Мб поставить максимальный объем кэша в настройках файловой системы в окне Свойства: Система.

Оптимизация работы оперативной памяти
Конечно, чем больше ОЗУ и чем быстрее его модули, тем лучше. Windows очень требовательна к объемам оперативной памяти. Поэтому, если Windows тормозит, купите на компьютер дополнительный модуль памяти. Это значительно повысит быстродействие.

У оперативной памяти есть такие параметры, как CAS, RAS-to-CAS, RAS. Они отвечают за скорость доступа к ячейке информации в ОЗУ. Причем, параметр CAS (латентность) здесь играет почти самую главную роль. Другие два отвечают за повторный доступ, если потребуется снова какая-то информация. Эти параметры называются таймингами. У всех почти модулей ОЗУ тайминги имеют скорость 3-3-3 (CAS, RAS-to-CAS, RAS). Измеряются эти величины в наносекундах (нс). Эти параметры можно повысить в BIOS до, например, 3-2-2. Помните, эти действия являются разгоном, так что тут Вы все делаете на свой страх и риск и никто отвечать за сгоревший модуль не будет. Поэтому лучше изменяйте эти параметры не спеша, по очереди, смотря каждый раз за стабильностью системы.
Удаляйте все ненужные компоненты из автозагрузки, так как они занимают лишние мегабайты ОЗУ. Также отключите все украшательства Windows.

Следующие ниже изменения в реестре позволяют оптимизировать работу памяти DRAM путем программного уменьшения времени ожидания. Путь: HKEY_LOCAL_MACHINE\System\CurrentControlSet\Services\VxD\BIOS, параметр dword - FastDRAM, значение - 00000001.

Можно использовать оптимизаторы памяти, типа Free Memory или MemMonster. Они просматривают ОЗУ, удаляют или выгружают в своп ненужные библиотеки.